Результаты хронического миелоидного лейкоза (ХМЛ) резко улучшились в результате лечения ингибиторами тирозинкиназы (TKI). Использование режима TKI может снизить биомаркер ХМЛ в крови до уровней, незаметных для существующих методов обнаружения. Для пациентов в "молекулярная ремиссия," однако остается неясность относительно того, будет ли у них рецидив или лечение следует прекратить. Исследование, опубликованное в The Journal of Molecular Diagnostics, описывает новый персонализированный цифровой анализ на основе ДНК, который выявляет стойкое заболевание в 81% образцов, взятых у группы пациентов, предположительно находящихся в стадии ремиссии.
"Если этот метод будет подтвержден в клинических испытаниях по отмене ИТК, он позволит более персонализированный подход к рекомендациям по снижению дозы или прекращению приема лекарств у отдельных пациентов, гарантируя, что лечение будет прекращено только у пациентов с наибольшим шансом на долгосрочную ремиссию," объяснила ведущий следователь и руководитель отдела Джейн Ф. Апперли, доктор медицины, доктор философии, FRCPath Центра гематологии Имперского колледжа (Лондон). Действительно, исследования показали, что 60% пациентов с ХМЛ, которые достигают устойчивых неопределяемых уровней транскриптов BCR-ABL1 – отличительного биомаркера ХМЛ – испытывают рецидив заболевания после отмены лечения TKI.
Исследователи сравнили чувствительность нового метода цифровой ПЦР на основе ДНК (dPCR) с тремя другими методами количественной ПЦР, используемыми в настоящее время для измерения остаточного ХМЛ, включая количественную ПЦР с обратной транскриптазой (RT-qPCR), количественную ПЦР (qPCR), и цифровая ПЦР с обратной транскриптазой (RT-dPCR). RT-qPCR в настоящее время является наиболее широко используемым методом мониторинга остаточной болезни у пациентов с ХМЛ.
Тридцать шесть образцов были взяты у шести пациентов с ранней стадией ХМЛ, которые, как считалось, находятся в состоянии глубокой молекулярной ремиссии, на что указывают результаты RT-qPCR. Повторный анализ с использованием цПЦР с преамплификацией выявил стойкое заболевание в 81% образцов. Для сравнения, частота обнаружения составила 25% при использовании RT-dPCR и 19% для qPCR. "Мы пришли к выводу, что цПЦР для ДНК BCR-ABL1 является наиболее чувствительным доступным методом обнаружения остаточного заболевания при ХМЛ и может оказаться полезным при лечении синдрома отмены TKI," заявил д-р. Apperley.
Новый анализ может существенно повлиять на лечение ХМЛ. Сразу после диагностики ХМЛ будут определены геномные контрольные точки пациента, что позволит разработать индивидуальный анализ для пациента. Ответ пациента на терапию будет контролироваться с помощью стандартной RT-qPCR до достижения молекулярной ремиссии. На этом этапе рутинный мониторинг будет дополнен цПЦР, что позволит принимать более обоснованные решения о лечении и улучшать ведение пациентов.
По словам доктора. Апперли, новый метод улучшает предыдущие методологии в двух ключевых областях. Во-первых, цПЦР – это метод на основе ДНК, который позволяет идентифицировать слитые соединения BCR-ABL1 с помощью целевого секвенирования следующего поколения. Это позволяет быстро создавать высокопроизводительные анализы зондов гидролиза на основе ДНК, которые специфичны для индивидуального молекулярного следа клона ХМЛ каждого пациента, хотя количество и расположение слитых соединений может варьироваться у разных пациентов. Второе преимущество нового метода связано с большей чувствительностью, обеспечиваемой платформой dPCR. "Описываемая нами методика, с помощью которой мы успешно картировали соединение для конкретного заболевания у всех протестированных пациентов, относительно проста, рентабельна и подходит для лаборатории с высокой пропускной способностью," отметил д-р. Apperley.