Группа исследователей, связанных с несколькими учреждениями в Канаде, выявила 15 генов-супрессоров опухолей, которые могут вызывать быстрый рост плоскоклеточного рака головы и шеи человека (HNSCC) при их мутации. В своей статье, опубликованной в журнале Science, группа описывает свой обратный генетический скрининг CRISPR, который позволил им проанализировать почти 500 генетических мутаций с длинным хвостом, которые приводят к HNSCC.
HNSCC является шестым по распространенности типом рака человека и, к сожалению, имеет низкую выживаемость. Как отмечают исследователи, на сегодняшний день большинство исследований, посвященных лечению, сосредоточено на нескольких генах, которые мутируют с очень высокой скоростью. Это дало им высокий статус. Но есть еще один класс более медленных мутирующих генов, которые могут приводить к опухолям у небольшого числа пациентов. Предыдущие исследования показали, что существуют сотни так называемых "длинный хвост" гены, многие из которых не были идентифицированы. В этом новом усилии исследователи использовали обратный генетический скрининг CRISPR, который позволил им идентифицировать 15 из них.
Работа сосредоточена на генах-супрессорах опухолей, регулирующих деление клеток. Когда с ними что-то идет не так, например, мутация, они теряют свою функцию и, таким образом, не могут предотвратить неконтролируемую мутацию клеток, которые они регулировали. В частности, команда сосредоточила свое внимание на генах в клетках, которые являются частью сигнального пути notch, в частности, на тех клетках, которые развиваются в опухоли HNSCC. У всех млекопитающих есть четыре типа рецепторов notch, которые используются для связи между клетками. Команда провела in vivo CRISPR-скрининг 484 мутаций гена с длинным хвостом, которые вызвали развитие опухолей у мышей, и определила 15 генов-супрессоров опухолей. Затем они искали такие же типы мутаций в мутациях длинного хвоста человека и смогли вычислить процентное соотношение для каждой из них.
Исследователи пришли к выводу, что 67% случаев HNSCC у человека происходят по сигнальному пути notch, что позволяет предположить, что инактивация notch является отличительной характеристикой HNSCC.