COVID-19 изменил жизни миллионов и даже миллиардов людей по всему миру. Заболевание вызывается коронавирусом SARS 2 (SARS-CoV-2), вирусом РНК, i.е. вирус, который использует РНК для хранения своей генетической информации. Чтобы противостоять ему, мы должны иметь детальное представление о структуре и функциях его отдельных белков.
Один из механизмов, который коронавирус использует, чтобы попытаться перехитрить наш иммунитет и убедить наши клетки в безвредности вирусной РНК, – это установка так называемых колпачков, специальных структур в начале РНК, благодаря которым вирусная РНК имитирует человеческую. РНК, позволяющая вирусу инфицировать человеческий организм и размножаться в нем.
Процесс установки кэпа катализирует белок коронавируса Nsp16 с участием другого вирусного белка, Nsp10. Возглавляет доктор. Евжен Буржа и доктор. Радим Ненцка, группа исследователей из Института органической химии и биохимии Чешской академии наук, использовала рентгеновскую кристаллографию для определения и анализа точной структуры комплекса этих двух белков.
Это позволило исследователям идентифицировать несколько фундаментальных характеристик белкового комплекса Nsp16 и Nsp10, а именно глубокий каньон на поверхности белкового комплекса, где происходит связывание вирусной РНК и устанавливается колпачок. Этот каньон может быть мишенью для ингибиторов, которые подавляют активность белкового комплекса Nsp16 и Nsp10 и, следовательно, всего процесса установки крышки, и в будущем могут служить лекарствами для борьбы со многими коронавирусами.
"Сотни исследовательских групп пытались пролить свет на то, как вирус COVID-19 может скрывать свою РНК от клеточного иммунитета. В конце концов, две американские команды и мы здесь, в Праге, добились успеха," объясняет Евжен Буржа, руководитель группы структурной мембранной биологии. "Мы использовали рентгеновский анализ, чтобы определить структуру ответственного вирусного фермента с ингибитором."
Исследователи опубликовали результаты своей работы в престижном журнале Nature Communications.