В исследовании, опубликованном 14 февраля 2017 в журнале Genome Biology, международной команде включая исследователей в американском Институте Генома Сустава Министерства энергетики (ДОУ ДЖДЖИ), Офис ДОУ Научного Пользовательского Средства, отчет, упорядочивающий геномы 10 новых разновидностей Aspergillus, более чем удваивая количество разновидностей Aspergillus, упорядоченных до настоящего времени. Недавно упорядоченные геномы были по сравнению с восемью другими упорядоченными разновидностями Aspergillus.
С этим самым первым представлением всего рода международный консорциум нашел, что у Aspergillus есть большее геномное и функциональное разнообразие, чем ранее понятый, расширение диапазона возможного применения для грибов рассмотрело одну из самых важных рабочих лошадей в биотехнологии.«Несколько разновидностей Aspergillus уже установили статус как фабрики по производству клеток для ферментов и метаболитов. Однако мало известно о разнообразии в разновидностях на геномном уровне, и данная статья демонстрирует, насколько разнообразный разновидности этого рода», сказал автор лидерства исследования Рональд де Ври из Грибкового Института Биоразнообразия Westerdijk в Нидерландах. «Нельзя предположить, что у разновидности Aspergillus будет та же самая физиология как лучшая изученная разновидность рода».Исследование, проводимое через Научную Программу Сообщества ДОУ ДЖДЖИ, также демонстрирует важность оценки биоразнообразия в роду, чтобы понять, как грибы могут быть больше используемый, чтобы решить множество проблем.
Упорядочивание разнообразного набора геномов Aspergillus позволяет исследователям строить более всесторонний каталог ферментов для биотехнологических заявлений, добавил ДОУ ДЖДЖИ Грибкового Главу Программы Геномики Игоря Григорьева, ведущего автора бумаги. Те заявления включают использование Aspergillus, чтобы помочь защитить зерновые культуры и отразить агентов, которые могут вызвать болезни на заводах.Уже сравнивая недавно упорядоченные геномы с доступными, исследователи нашли огромное множество активных против углевода ферментов (CAZymes) среди разновидностей Aspergillus, предложив отличные стратегии расщепить биомассу завода.
CAZymes ответственны за разрушение стен растительной клетки, полезны для промышленно предприятий по переработке, САМКА рассматривает зерновые культуры биоэнергии кандидата. К сахару, который является частью этих клеточных стенок, нельзя получить доступ и волновать, чтобы сделать биотопливо, если стены не сломаны агентами как CAZymes.«Каждый из этих 10 геномов кодирует для уникального состава CAZymes – и более широкий ассортимент помогает сформулировать коктейли фермента, которым лучше удовлетворяют для различных типов биомассы завода, чтобы эффективно преобразовать их в биотопливо», сказал Григорьев.В дополнение к биотопливу CAZymes может также помочь облегчить производство бумаги, текстиля, еды, подачи и фармацевтических препаратов, по словам де Ври.
Сравнительный анализ между геномами также позволил исследователям раскрыть высокое разнообразие генов что: 1) позвольте грибам производить вторичные метаболиты, комплексы, которые могут быть полезны для заявлений, таких как защита сельскохозяйственных культур; и 2) позвольте грибам терпеть напряжение. Знание, полученное во вторичном метаболизме и ответе напряжения, поможет обеспечить больше понимания в механизмах, лежащих в основе этих функций.
Но несмотря на новое понимание извлек пользу, де Ври подчеркивает так много, все еще остается неизвестным о полном спектре того, что может сделать Aspergillus. «Есть [все еще] очень, чтобы учиться и добраться от лучшего исследования [Aspergillus]», сказал он. «Потенциал для заявлений в роду был едва затронут». Григорьев добавляет: «Поощренный результатами этого исследования мы теперь преследуем более глубокое исследование рода Aspergillus, упорядочивая оставление 300 разновидностями, каждый несущий уникальный состав гены, ферменты и пути»