Лаборатория генетики распутывает таинственного кита, убивающего в море

Наблюдатели приблизительно на 200 милях обзора млекопитающего морского пехотинца Рыболовства NOAA недалеко от берегов Центральной Калифорнии определили контрольные признаки нападения косатки через мощный бинокль на расстоянии в несколько миль. Бешеное плавание взболтало океанскую поверхность. Гейзеры кровавой воды распылены в воздух.

Голодные морские птицы кружились в поисках остатков.Но к тому времени, когда большое исследовательское судно прибыло в сцену, все биологи могли найти, была пленка нефти от исчезнувшей жертвы. Это, и легкие неопознанного животного и сердце.Который был всеми доказательствами, Бриттани Хэнкок-Хэнсер было нужно.

Биолог-исследователь в Marine Mammal Genetics Group в Юго-западном Научном центре Рыболовства в Ла-Хойе, Калифорния, Хэнкоке-Хэнсере и ее коллегах дразнит информацию от самых крошечных следов жизни. Их цель – ДНК, которая держит генетический код каждого существа, определяя виды животного, идентичность, эволюционное происхождение, семейные отношения и больше.В случае восстановленных легких и сердца, те тайны обеспечили бы новое понимание животного, на которое напали косатки.«Мы не знали, каково то животное было», Хэнкок-Хэнсер вспоминает. «Но, учитывая способность нашей лаборатории и сколько работы мы сделали на животных из семейства китовых, мы знали, что у нас был довольно хороший шанс понимания этого».

Поиск генетической библиотекиВ Юго-западном Научном центре Рыболовства размещается одна из крупнейших коллекций ткани и образцов ДНК от морских млекопитающих и морских черепах в мире, все сохраненные в гигантских морозильниках. Это включает приблизительно 175 000 образцов ткани примерно от 145 000 уникальных животных и больше чем 60 000 образцов ДНК, представляющей фактически каждый известный вид морского млекопитающего и морской черепахи.Каждому образцу связали уникальный штрихкод с базой данных с деталями о том, куда он прибыл из и как он был изучен.

Размер коллекции делает его мощным генетическим инструментом. Чем больше примеров ДНК, которые доступны, тем лучший шанс Хэнкок-Хэнсер имел бы соответствия ДНК от восстановленного сердца и легких к известной разновидности и, в свою очередь, определяя, из какого животного они произошли.«Мы работали с в значительной степени каждой китовой разновидностью есть, таким образом, мы можем сравнить генетику с этой огромной библиотекой материала и изучить много того пути», говорит Филип Морин, исследование молекулярный биолог в Marine Mammal Genetics Group. «От образца, не намного больше, чем верхняя часть булавки, мы можем изучить много и в человеке и в уровне разновидностей».

Нахождение генетического отпечатка пальцаНазад в лаборатории, Келли Робертсон, другой член команды генетики, начала анализ восстановленного сердца и легкого. Сначала она извлекла ДНК с ферментами, которые проникли в ткани легкого и открыли ее камеры.

Затем она убрала ДНК через ряд мытья алкоголя за несколько дней. Тогда она и ее коллеги использовали специализированные ферменты, чтобы копировать ДНК много раз, предоставляя достаточно копий им, чтобы проанализировать в лаборатории.Автоматизированная система тогда исследовала конкретную часть последовательности ДНК, которая, как известно, отличала различные морские виды млекопитающих, показав результаты как серию пиков в концентрациях молекул, которые являются стандартными блоками ДНК.

Целый процесс занял немногим более, чем неделю и дал часть команды генетического отпечатка пальца животного, которое стало жертвой взбешенных косаток далеко в открытом море.Компьютер сравнил генетическую последовательность с базой данных видов китов, курировавших Marine Mammal Genetics Group, и быстро определил добычу: карликовый кашалот. Этот вид маленького кита, не намного более крупного, чем многие дельфины, редко замечается и известен в основном посредством анализа некоторых, это иногда оказывается на мели на берег.

Действительно, открытие также разоблачающее с точки зрения косаток, которые не были зарегистрированы как охотящийся на карликовых кашалотов в Тихом океане. Новые доказательства, что они делают, подчеркивают их позицию главных хищников, которые могут убить почти любое другое морское млекопитающее, которому дают шанс.

«Мы не смогли добраться там достаточно скоро, чтобы видеть, что продолжалось», сказал Хэнкок-Хэнсер. «Но через генетику мы могли соединить то, что произошло, и узнайте о чем-то новом из результата».