Оригинальное исследование, изданное в журнале Frontiers in Molecular Biosciences, показывает, что метод OncoFinder значительно уменьшает ошибки, введенные экспериментальными методами всего транскриптома. Ученые сравнили данные об экспрессии гена для тех же самых биологических образцов, полученных и упорядочивающим следующим поколением (NGS) и методами микромножества, найдя, что у этих различных методов нет почти корреляции между ценностями экспрессии гена для всех проанализированных наборов данных. Напротив, когда алгоритм OncoFinder применен к данным, четкая корреляция между упорядочивающим следующим поколением и наборами данных экспрессии гена микромножества была замечена.«В течение нескольких лет потенциал для использования данных об экспрессии гена в исследовании и клинических заявлениях был недооцениваем из-за несоответствия данных, прибывающих из различных типов оборудования.
Есть только слишком много изменения и сложности, сравнивая крупное количество отдельных генов. Но когда эта сложность уменьшена, и экспрессия гена нанесена на карту на сигнальные пути, мы можем оценить активацию пути, дрейфуют и анализируют изменения и переходы очень эффективнее.
Алгоритм OncoFinder позволяет ученым характеризовать функциональные состояния транскриптомов более точно, чем прежде, и мы надеемся, что это станет предпочтительным методом в генетике, физиологии, биомедицине и молекулярной диагностике», сказал Алекс Жаворонков, доктор философии, директор BGRF и соавтор исследования.