Исследователи Otago, изучающие вирус COVID-19 (SARS-2), обнаружили потенциальные целевые точки в его геноме, которые могут способствовать будущему лечению вируса.
В то время как их лаборатория была закрыта в период уровня 4, доктор философии.D. студент Али Хоссейни и профессор Алекс Маклеллан из отдела микробиологии и иммунологии работали на дому, чтобы заняться новой областью патогенеза COVID-19.
Ведущий автор г-н Хоссейни надеется, что эта работа будет способствовать лучшему пониманию того, как вирус ускользает от иммунного ответа хозяина, и внесет свой вклад в разработку ослабленных вирусных вакцин.
Исследователи применили свои навыки в области микроРНК (miRNA), полученные из их обычной темы изучения противораковых CAR Т-клеток, чтобы изучить ранее нераспознанные слабые места в геноме SARS-2, которые можно было бы использовать для уничтожения вируса или помощи в создании вируса. новые вакцины.
Эти слабые места вируса – сайты-мишени, распознаваемые миРНК хозяина – основанная на нуклеиновых кислотах «иммунная система», действующая во всех клетках нашего организма.
Важные для контроля экспрессии генов в клетке, miRNA также играют важную роль в распознавании и уничтожении вирусов.
Один целевой сайт на SARS-2 соответствует обильному количеству miRNA (miR197), присутствующему в очень высоких количествах у пациентов с сердечно-сосудистыми осложнениями или с респираторно-вирусными инфекциями.
Сайт связывания miR197 на SARS-2 был независимо мутирован почти 40 раз с марта этого года. Эта мутация в настоящее время присутствует более чем в 75 процентах глобальных изолятов SARS-2.
"Доказано, что пациенты с сердечно-сосудистыми осложнениями подвержены риску заражения COVID-19," говорит профессор Маклеллан.
"Наше исследование предполагает, что нормальный защитный путь у этих пациентов мог быть заблокирован этой мутацией в вирусе."
Однако он говорит, что еще слишком рано говорить, помогут ли такие мутации вирусу, или это просто нейтральные автостопщики, которые не дают вирусу никаких преимуществ.
"Нам нужны прямые экспериментальные подходы с использованием живого вируса, а также дальнейшее изучение передачи таких мутантов по всему миру.
"Тем не менее, было удивительно узнать, как часто сайт-мишень miR197 мутировал в разных изолятах SARS-2.
"Наше исследование просто говорит: давайте следить за этими сайтами и посмотрим, что с ними произойдет в будущем."
Ведущий автор Али Хоссейни говорит, что из-за того, что многие miRNA различаются между видами, недавно появившийся «зоонозный» SARS-2 может столкнуться с характерной атакой miRNA человека, которая ранее не наблюдалась у летучих мышей.
Исследователи говорят, что их результаты также открывают возможность создания искусственных сайтов miRNA. Это может быть полезно для ослабления вируса для исследования вакцины и было успешно выполнено экспериментально для других респираторных вирусов.
Такие стратегии в отношении вируса SARS-2 могут внести вклад во всемирные усилия по созданию вакцины.
Исследование недавно прошло рецензирование и опубликовано на этой неделе в Международном журнале молекулярных наук.