«Мы пытались найти гены, которые дифференцируют гибриды сахарной кукурузы, у которых есть потенциал, чтобы произвести более высокие урожаи под толпящимся напряжением против гибридов с более низкими урожаями при тех же самых растущих условиях», объясняет U, я подрезаю научного исследователя Юнсу Чо.Choe и ее команда измерили заметные или фенотипичные черты для высокого – и низкодоходные гибриды под толпящимся напряжением; эти включенные черты, которые, как известно, коррелировали с толпящимся напряжением, таким как высота завода, область листа, и время к зрелости.
Другие черты, такие как урожай, ядерная масса, ядерная влажность, и заполняются, процент были также измерены. Наконец, команда извлекла генетический материал из заводов, чтобы исследовать корреляции между образцами экспрессии гена и измеренными чертами.«Мы нашли группы генов, которые были связаны, чтобы уступить под толпящимся напряжением», говорит Чо.Хотя образцы экспрессии гена указали, что каждый гибрид использовал уникальные механизмы для признания толпящегося напряжения, исследователи действительно подтверждали общее генетическое основание для ответа урожая в этих шести проверенных гибридах.
Низкодоходным гибридам связали активность гена с различными ответами напряжения, в то время как высокодоходные гибриды использовали активность гена, более непосредственно связанную с накоплением углевода.Чо говорит, что гены, связанные с ростом клеток, были распространены в низкодоходных гибридах; эти гены могут быть ответственны за задержанный расцвет под толпящимся напряжением. С другой стороны гены, связанные с метаболизмом углевода, были распространены в высокодоходных гибридах; эти гены могут коснуться поддержания урожая под толпящимся напряжением.«Кластеры генов, которые мы определили, были очень широки в их биологических функциях», отмечает Чо. «Наши результаты должны будут быть проверены далее на агрономическое улучшение заводчиками.
Но сужение генофонда тем, которые скорее всего, влияют на урожай, является важным шагом».Статья, «Идентификация толпящихся сетей коэкспрессии терпимости напряжения, вовлеченных в урожай сахарной кукурузы», опубликована в PLoS ОДИН.
Мартин Уильямс, эколог в Министерстве сельского хозяйства США ARS и Университет Иллинойса, и Дженни Дрневич, специалист по биоинформатике в Университете Иллинойса, также способствовал бумаге.