Ученый Рочестерского технологического института и выпускник RIT близко к завершению генетического проекта или микробиома, виноградной болезни опухоли злобы короны – отрава виноградников во всем мире. Их исследование сосредотачивается на 16 виноградных видах, включая Совиньон Каберне и Рислинг, от виноградников в нью-йоркском регионе Озер Пальца, штат Нью-Йорк Корнелльского университета Сельскохозяйственная Станция Эксперимента в Женеве, Нью-Йорке и Миссури. Виноградный Мускат видов Ottonel, Vitroblack и Muscat Александрии был также выбран от виноградников в Венгрии, Тунисе и Японии, соответственно.
Согласно Винному Кокусу Конгресса, коалиция американских представителей и сенаторов, американского вина, винограда и виноградных отраслей промышленности продуктов приводила больше чем к $162 миллиардам ежегодно американской экономике в 2007. Позже, в феврале, нью-йоркский Винный и Виноградный Фонд сообщил о воздействии на экономику за $4,8 миллиарда о штате Нью-Йорк, на основе данных 2012 года.
«Мы на расстоянии приблизительно в шесть месяцев от наличия данных, чтобы полностью описать бактериальный микробиом опухолей виноградной лозы», сказал Майкл Сэвка, преподаватель биологических наук в Школе Томаса Х. Госнелла Наук о жизни в RIT, и организатор и участник международного исследования. «Понимая микробный состав больного государства на и в виноградной лозе коронуют опухоль злобы, мы можем начать формулировать информированное биологическое рассмотрение контроля – лучшие смеси защитных бактериальных разновидностей – чтобы уменьшить инфекцию, которая приводит к развитию опухолей злобы короны в виноградниках».Вся экологическая ДНК виноградной болезни опухоли злобы короны показана в генетическом профиле на основе 52 образцов ткани опухоли злобы короны, зараженной от 16 разновидностей виноградной лозы.
Зараженные виноградные разновидности были выращены в пяти географических положениях и на четырех различных континентах, включая Северную Америку, Европу, Африку и Азию. Полное экологическое понимание микробного населения связалось с Agrobacterium vitis, мог улучшить управление ходом заболевания и подрезать производство всех видов винограда, сказал Сэвка.Виноградная злоба короны – хроническая болезнь, которая испытывает недостаток в эффективном лечении и является трудной уничтожить.
Бактерии входят в виноградную лозу посредством пересадок ткани или ран и распространения через сосудистую ткань завода. Системная инфекция развивается в раздутые узлы или злобы, которые морят завод по производству голодом воды и питательных веществ, необходимых для надлежащего роста и развития.
Иногда скрытая болезнь может унести жизни виноградников, подчеркнуть зрелые виноградные лозы и сохраниться в почве и в распадающемся вопросе завода в течение многих лет.Главный в исследовании вклады сотрудника Сэвки и бывшего студента, Хань Мин Ганя, научного сотрудника в университете Монаша Малайзия и 20:08 выпускник биотехнологии RIT. Гань, эксперт в платформах упорядочивающего ДНК следующего поколения, развивал технический подход, который отделяет ДНК бактерий от близких родственников в archaea – группе одноклеточных микроорганизмов – от ДНК растительной клетки.
Он определил основной микробиом, характерный для всех 52 выбранных опухолей, который состоит из трех различных разновидностей Agrobacterium, одной разновидности Erwinia и Novosphingbium и одного участника от Enterobacteriaceae и Microbacteriaceae.«Теперь, когда мы определили основной микробиом опухоли злобы короны, следующий шаг должен был бы предсказать роль другие напряжения non-Agrobacterium в злобе короны на основе их идентичности», сказал Гань.
Команда также оценивает, существуют ли различия в климате, виноградном культурном сорте растения и в типе опухоли. Дополнительные образцы были собраны в этом году в Венгрии и Тунисе, отметил Сэвка.
Результаты от исследования были изданы как часть слушаний американского Общества Микробиологии 2014, встречающийся в Бостоне.