Последнее исследование было опубликовано онлайн по своей природе Коммуникация.Несмотря на репутацию больших кошек свирепости, эти величественные разновидности сталкиваются с большей опасностью, чем они позируют: Все подвергаются опасности, главным образом из-за потери среды обитания, вмешательства и истощающихся запасов продовольствия. Как самые большие виды животных из семейства кошачьих на земле, тигр стал одним из в мире большинство вымирающих видов. Понимание генетического разнообразия и демографии тигра было очень ограничено без последовательности целого генома тигра или любой из разновидностей Panthera.
В этом исследовании исследователи упорядочили целый геном Амурского тигра, также известного как сибирский тигр, и собрались, это, используя ГРАФИЧЕСКИЙ ИНТЕРФЕЙС ФИРМЫ BORLAND саморазработало программное обеспечение SOAPdenovo. Амурский геном тигра был предсказан, чтобы содержать 20 226 кодирующих белок генов и 2 935 некодирующих РНК, и был обогащен в обонятельной чувствительности рецептора, транспорте аминокислоты и метаболически-связанных генах, среди других. Кроме того, исследователи нашли, что Амурский геном тигра показал больше чем 95-процентное подобие геному домашней кошки.
Исследователи также упорядочили геномы другого белого Бенгальского тигра Panthera-a, африканского льва, белого африканского льва и использующей снежного барса упорядочивающей технологии следующего поколения, и выровняли их использующий последовательности генома тигра и домашней кошки. Они обнаружили много Panthera определенные для происхождения и определенные для животного из семейства кошачьих изменения аминокислоты, которые могут затронуть пути метаболизма. Эти сигналы метаболизма аминокислоты были связаны с обязательной плотоядной диетой.
Кроме того, команда показала доказательства, что гены, связанные с силой мышц, а также энергетическим метаболизмом и сенсорными нервами, включая обонятельную деятельность рецептора и визуальное восприятие, казалось, подвергались быстрой эволюции у тигра.Предыдущие исследования показали, что человеческие места EGLN1 (Egl девять гомологов 1) и EPAS1 (эндотелиальный белок содержащего область ПЕРВЕНСТВА 1) являются двумя ключевыми факторами для посредничества высотной адаптации. В этом исследовании команда нашла, что у снежного барса были уникальные изменения аминокислоты в обоих генах, которые, возможно, внесли в приобретение снежным барсом альпийской, большой высоты экологическую нишу.Кроме того, исследователи нашли, что белые львы содержат вариант в гене TYR.
Варианты в TYR, как ранее сообщали, были связаны с белым пальто, раскрашивают домашних кошек, а также с формой альбинизма у людей. Белый вариант льва, казалось, привел к изменению аминокислоты, которое, кажется, затрагивает обвинение получающегося белка.
Наблюдая генетическое разнообразие разновидностей, исследователи нашли, что генетическое разнообразие тигра и льва было подобно тому из человека. Интересно, разнообразие генома снежного барса было почти вдвое меньше чем это других разновидностей Panthera и немного ниже, чем тот из тасманийского дьявола.Амурский геном тигра – первый справочный геном, упорядоченный от происхождения Panthera и второго от разновидностей Felidae. Данные из тигров, львов и снежных барсов обеспечивают богатый и разнообразный ресурс генома, который мог использоваться в будущих исследованиях геномики населения и сохранения.
Генетика подкрепляет местную адаптацию и потенциальное межродственное скрещивание, и/или outbreeding в диком и пленном населении может быть освещен и таким образом помочь гарантировать будущее выживание этих величественных разновидностей.